CCII 京都大学大学院医学研究科附属 がん免疫総合研究センター

飯田 慶 特定准教授
インフォマティクス・プラットフォーム


学歴

  • 2002: 2002: 名古屋大学大学院 理学研究科 生命科学専攻 博士前期課程修了
  • 2006: 名古屋大学大学院 理学研究科 生命科学専攻 Ph.D.取得

職歴

  • 2002: 理化学研究所 ゲノムサイエンスセンター テクニカルスタッフ
  • 2004: 長浜バイオ大学 バイオサイエンス学部 助手
  • 2007: カリフォルニア州立 カリフォルニア大学 リバーサイド校 ポスドク
  • 2008: 理化学研究所 生命情報基盤研究部門 研究員
  • 2012: 京都大学大学院 医学研究科 医学研究支援センター 特定助教
  • 2022~: 近畿大学 理工学部 生命科学科 講師
  • 2024~: 京都大学大学院 医学研究科 がん免疫総合研究センター インフォマティクス・プラットフォーム 特定准教授(クロスアポイントメント)

主な論文

Minegishi M, Kuchimaru T, Nishikawa K, Isagawa T, Iwano S, Iida K, Hara H, Miura S, Sato M, Watanabe S, Shiomi A, Mabuchi Y, Hamana H, Kishi H, Sato T, Sawaki D, Sato S, Hanazono Y, Suzuki A, Kohro T, Kadonosono T, Shimogori T, Miyawaki A, Takeda N, Shintaku H, Kizaka-Kondoh S, Nishimura S. Secretory GFP reconstitution labeling of neighboring cells interrogates cell-cell interactions in metastatic niches. Nat Commun. 2023 Dec 5;14(1):8031. DOI: 10.1038/s41467-023-43855-2. PMID: 38052804; PMCID: PMC10697979.

Miyamoto M, Kawato Y, Fujie R, Kurowarabe K, Fujiwara K, Nobusawa R, Hayashi R, Iida K, Ohigashi I, Hayasaka H. CCL21-Ser expression in melanoma cells recruits CCR7+ naïve T cells to tumor tissues and promotes tumor growth. Cancer Sci. 2023 Sep;114(9):3509-3522. DOI: 10.1111/cas.15902. Epub 2023 Jul 8. PMID: 37421165; PMCID: PMC10475776.

Matsushima S, Ajiro M, Iida K, Chamoto K, Honjo T, Hagiwara M. Chemical induction of splice-neoantigens attenuates tumor growth in a preclinical model of colorectal cancer. Sci Transl Med. 2022 Nov 30;14(673):eabn6056. DOI: 10.1126/scitranslmed.abn6056. Epub 2022 Nov 30. PMID: 36449604.

Toyomoto M, Inoue A, Iida K, Denawa M, Kii I, Ngako Kadji FM, Kishi T, Im D, Shimamura T, Onogi H, Yoshida S, Iwata S, Aoki J, Hosoya T, Hagiwara M. S1PR3-G12-biased agonist ALESIA targets cancer metabolism and promotes glucose starvation. Cell Chem Biol. 2021 Aug 19;28(8):1132-1144.e9. DOI: 10.1016/j.chembiol.2021.01.004. Epub 2021 Feb 8. PMID: 33561428.

Iida K, Hagiwara M, Takeuchi A. Multilateral Bioinformatics Analyses Reveal the Function-Oriented Target Specificities and Recognition of the RNA-Binding Protein SFPQ. iScience. 2020 Jul 24;23(7):101325. DOI: 10.1016/j.isci.2020.101325. Epub 2020 Jun 28. PMID: 32659723; PMCID: PMC7358709.

Merkurjev D, Hong WT, Iida K, Oomoto I, Goldie BJ, Yamaguti H, Ohara T, Kawaguchi SY, Hirano T, Martin KC, Pellegrini M, Wang DO. Synaptic N6-methyladenosine (m6A) epitranscriptome reveals functional partitioning of localized transcripts. Nat Neurosci. 2018 Jul;21(7):1004-1014. DOI: 10.1038/s41593-018-0173-6. Epub 2018 Jun 27.

FANTOM Consortium and the RIKEN PMI and CLST (DGT). A promoter-level mammalian expression atlas. Nature. 2014 Mar 27;507(7493):462-70. DOI: 10.1038/nature13182. PMID: 24670764; PMCID: PMC4529748.

Iida K, Jin H, Zhu JK. Bioinformatics analysis suggests base modifications of tRNAs and miRNAs in Arabidopsis thaliana. BMC Genomics. 2009 Apr 9;10:155. DOI: 10.1186/1471-2164-10-155. PMID: 19358740; PMCID: PMC2674459.

Zheng X, Pontes O, Zhu J, Miki D, Zhang F, Li WX, Iida K, Kapoor A, Pikaard CS, Zhu JK. ROS3 is an RNA-binding protein required for DNA demethylation in Arabidopsis. Nature. 2008 Oct 30;455(7217):1259-62. DOI: 10.1038/nature07305. Epub 2008 Sep 24. PMID: 18815596; PMCID: PMC2782394.

Iida K, Go M. Survey of conserved alternative splicing events of mRNAs encoding SR proteins in land plants. Mol Biol Evol. 2006 May;23(5):1085-94. DOI: 10.1093/molbev/msj118. Epub 2006 Mar 6. PMID: 16520337.

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